Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms