Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2al1jA2BFR3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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