Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms