Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ism1A2ATD1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ism1A2ATD1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ism1A2ATD1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ism1A2ATD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.2 ms