Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabreA2AMW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms