Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms