Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc183A2AJB1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc183A2AJB1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms