Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34dA2AGU5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms