Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms