Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms