Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms