Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms