Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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