Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms