Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms