Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm5538W4VSP6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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