Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms