Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26992S4R1A3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm26992S4R1A3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms