Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms