Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms