Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms