Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letm1Q9Z2I0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms