Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms