Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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