Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms