Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms