Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog1Q9Z160 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms