Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne6Q9Z140 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms