Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ror1Q9Z139 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms