Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms