Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms