Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VapaQ9WV55 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VapaQ9WV55 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VapaQ9WV55 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VapaQ9WV55 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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