Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf4Q9QZS2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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