Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms