Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 400.9 ms