Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms