Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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