Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2e3Q9QXZ7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms