Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip1Q9QXX8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms