Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms