Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms