Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms