Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms