Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms