Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mid2Q9QUS6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms