Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms