Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms