Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclk1Q9JLM8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms