Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Col5a3Q9JLI2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Col5a3Q9JLI2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Col5a3Q9JLI2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms