Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nectin3Q9JLB9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nectin3Q9JLB9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nectin3Q9JLB9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Nectin3Q9JLB9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Nectin3Q9JLB9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Nectin3Q9JLB9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Nectin3Q9JLB9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nectin3Q9JLB9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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